Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NXPE4Q6UWF7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NXPE4Q6UWF7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms