Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DUX4L9Q6RFH8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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