Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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ECM1Q16610 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECM1Q16610 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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