Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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