Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ACKR1Q16570 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms