Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP6AP1Q15904 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms