Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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