Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD1Q15327 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms