Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RABEP1Q15276 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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