Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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