Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FRMPD4Q14CM0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FRMPD4Q14CM0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms