Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMCO1Q147U7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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SMCO1Q147U7 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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