Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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UBE2V1Q13404 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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UBE2V1Q13404 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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UBE2V1Q13404 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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UBE2V1Q13404 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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