Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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PMS2P3Q13401 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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PMS2P3Q13401 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PMS2P3Q13401 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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