Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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SCGB2A2Q13296 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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SCGB2A2Q13296 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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SCGB2A2Q13296 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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SCGB2A2Q13296 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SCGB2A2Q13296 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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