Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms