Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
STX4Q12846 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
STX4Q12846 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms