Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18A2Q05940 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms