Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms