Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms