Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms