Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MC1RQ01726 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms