Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms