Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms