Protein–RNA interactions for Protein: P80404

ABAT, 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABATP80404 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABATP80404 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABATP80404 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABATP80404 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABATP80404 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABATP80404 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABATP80404 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABATP80404 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABATP80404 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABATP80404 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABATP80404 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABATP80404 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABATP80404 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABATP80404 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABATP80404 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms