Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VSX2P58304 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VSX2P58304 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VSX2P58304 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VSX2P58304 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms