Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA9P57773 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA9P57773 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA9P57773 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA9P57773 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA9P57773 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA9P57773 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA9P57773 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA9P57773 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA9P57773 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA9P57773 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA9P57773 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA9P57773 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA9P57773 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA9P57773 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA9P57773 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms