Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NME5P56597 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NME5P56597 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME5P56597 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME5P56597 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME5P56597 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME5P56597 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME5P56597 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME5P56597 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME5P56597 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NME5P56597 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms