Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TPD52P55327 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TPD52P55327 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TPD52P55327 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TPD52P55327 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TPD52P55327 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TPD52P55327 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TPD52P55327 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TPD52P55327 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TPD52P55327 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TPD52P55327 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TPD52P55327 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TPD52P55327 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TPD52P55327 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TPD52P55327 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TPD52P55327 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPD52P55327 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms