Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB28P51157 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB28P51157 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms