Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PLNP26678 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms