Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EFNA1P20827 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EFNA1P20827 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms