Protein–RNA interactions for Protein: P18507

GABRG2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG2P18507 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRG2P18507 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms