Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TPRP12270 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPRP12270 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPRP12270 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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