Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms