Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSLP07711 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSLP07711 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSLP07711 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSLP07711 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSLP07711 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSLP07711 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSLP07711 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSLP07711 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSLP07711 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSLP07711 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms