Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX3O95343 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX3O95343 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX3O95343 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX3O95343 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX3O95343 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX3O95343 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX3O95343 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX3O95343 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX3O95343 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX3O95343 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX3O95343 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX3O95343 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms