Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms