Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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MTSS1O43312 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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MTSS1O43312 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTSS1O43312 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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