Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GFRA2O00451 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms