Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PRAMEF25A6NGN4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PRAMEF25A6NGN4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PRAMEF25A6NGN4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PRAMEF25A6NGN4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PRAMEF25A6NGN4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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