Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms