Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms