Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP15Q9Y4E8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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