Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms