Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOMER3Q9NSC5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms