Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms