Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms