Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms