Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HINFPQ9BQA5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms